『福音战士新剧场版：破』的故事发展是根据电视版第8话至第19话，但由于庵野秀明希望能打破EVA世界，所以把第23话剧情也加进去。除此之外，亦加入新人物、新机体、新剧情，似乎他以Mr.EVA之手把原有的EVA世界完完全全破坏了……
美里：「听说在香港有EVA 5号机跟使徒战斗。驾驶者是个这样的人」。驾驶者就是全新女主角「真希波‧真理‧伊卢崔亚斯」，她将会空降战场协助真嗣和绫波丽等人。「式波‧明日香‧兰格雷」隆重登场，她将会驾驶全新的EVA2号机参战，而且更会代替某人的EVA出战。当碇真嗣口里不断说「不驾驶不驾驶」，最后还是决定驾驶EVA初号机，向着未知的领域进发。
新角色加上新EVA，会有怎样的关联？一幕幕震惊的画面，充满神秘的EVA世界改变了，全球EVA迷定必拭目以待！
